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收到虚拟号码短信的举报方式有多种，以下提供三种方法。
1、直接向运营商举报：运营商会协助相关部门进行查处，以收到诈骗短信为例，可以拨打客服电话，告知客服该短信为诈骗短信并提供短信内容、短信号码等相关信息，运营商会进行核实处理。
2、向公安机关举报：如果短信内容涉及诈骗行为或者违法信息，可以向公安机关举报，可以通过拨打当地公安机关的举报电话或者前往当地公安机关报案，在举报时，提供相关证据和信息，如短信内容、短信号码等，以便公安机关进行调查处理。
3、在相关软件或平台上进行举报：一些安全软件或平台上也提供了举报功能，可以在手机应用商店下载相关的安全软件，并在软件内找到相关的举报入口进行举报，一些网站或社交媒体平台也提供了举报功能，可以在这些平台上找到相关的举报入口进行举报。
无论采取哪种方式，建议保留好相关证据和信息，以便相关部门进行调查处理，也要加强自我防范意识，谨慎处理个人信息和资金安全。